Sebelum memulai membuat bonsai, kita harus tau jenis-jenis tanaman apa saja yang bisa dibuat untuk bonsai. Sebenarnya hampir semua tanaman bisa dibuat bonsai, terutama tanaman yang kuat, berkayu keras, berbentuk pohon, berumur panjang, berdaun dan berbuah/berbunga kecil, serta cocok dengan iklim di Indonesia. Umumnya yang diambil adalah tanaman dikotil, yaitu tanaman yang buahnya berkeping dua. Tetapi ada juga tanaman yang tidak haru memenuhi kriteria-kriteria yang disebutkan diatas, contohnya bonsai kelapa, bonsai bambu, bonsai adenium dan lain-lain. Namun bonsai tersebut tidak bisa disebut sebagai bonsai sejati.
Berikut contoh jenis-jenis tanaman untuk bonsai:
| Asam Jawa Tamarandus Indica | Asam Kranji Dialum Indum | Asam Belanda Phitecellobium | Kemuning Murraya Panniculata | Jeruk Kingkit Triphasia Trifolia |
| Kawista Feronia Limonia | Kawista Krikil Feronia Lucida | Kembang Jepun Acacia Varnenciana | Landepan Barleria Prionitis | Maja Aegle Marmelos |
| Cendrawasih Phylantus Nenuri | Mirten Malphigia Coccigera | Murabi Morus Alba | Mustam Diospyros Mantana | Soka Ixora Coccinea |
| Anting Putri Wrightia Religiosa | Hokkian Carmona Mycrophylla | Serut Pagar Carmona Retusa | Cermai Belanda Euginia Uniflora | Duwet Euginia Cemini |
| Jambu Biji Psidium Guajava | Kacapiring Gardenia Agusta | Nam-Nam / Kepel Cynometra Caulifora | Pilang Acacia Leocophloea | Rukem Flacourtia Indica |
| Sisir Cudrania Cochin Sinensis | Trenggulun Protium Javanicum | Melati Jasminium Officinale | Pyracanta Pyracanta Grenulata | Wareng Gmelina Asiatica |
| Ulmus Ulmus Parfiflora | Karet Kimeng Ficus Retusa | Bunut Ficus Glauca | Pinus Pinus Mercusii | Black Pine Pinus Thumbergii |
| Delima Punica Granatum | Santigi Phempis Acidula | Azalea Rhododendron Indica | Pinus Pinus Mercusii | Cemara Udang Casuarina Equisetifolia |
| Cemara Duri Juniperus Rigida | Cemara Paua Juniperus Cinensis | Cemara Buaya Juniperus Horisontalis | Cempaka Kuning Michelia Champaka | Sancang Phemna Microphylla |
Tentunya masih banyak lagi jenis-jenis tanaman yang bisa dibuat bonsai. Untuk memperoleh calon bonsai tersebut bisa baca di jenis-jenis asal bibit untuk bakalan bonsai.
